In Voxel Bot spielst du einen Roboter, der alle Würfel im Level abräumen muss. Indem du von Würfel zu Würfel springst, änderst du die Farbe der Würfel, und wenn alle Würfel lila sind, hast du das Level geschafft. Um dein Ziel zu erschweren, gibt es Feinde, die du nicht berühren darfst oder die versuchen, dich zu fangen. Um es noch herausfordernder zu gestalten, gibt es Stacheln, die ausschlagen, wenn du zu lange untätig auf einem Würfel verweilst. Die Level werden mit fortschreitendem Spiel komplexer. Neue Mechaniken werden eingeführt, wie ein grüner Würfel, der dich weiter springen lässt, und ein Würfel, der durch Drücken eines Buttons massiv oder nicht massiv sein kann.