Eine junge Magierin sammelt Juwelen für ihre magischen Kräfte in einem dunklen und düsteren Zauberwald. Sie muss magische Juwelen sammeln, die Elemente wie Feuer, Erde, Wasser und Donner enthalten. Du musst ihr helfen, diese Juwelen zu sammeln, aber du hast nur 100 Züge, um alle Ziele zu erreichen. Mit jedem abgeschlossenen Ziel steigst du ein Level auf und verdienst mehr Punkte. Jewel Mysteries ist ein stark auf Highscores basierendes Spiel mit Zielen und begrenzten Zügen. Du musst Juwelen entfernen, indem du auf Gruppen von 3 oder mehr Juwelen klickst. Wenn du eine aufeinanderfolgende Kombo von 7 schaffst, trittst du in den Juwelen-BURST-Modus ein. Im Juwelen-BURST-Modus erhältst du doppelte Punkte.